La papaina è un enzima naturale al 100% che si trova in alte concentrazioni nel frutto della papaia. L'enzima proteolitico è composto da più di 200 aminoacidi. Soprattutto la buccia ancora verde, i semi e il succo lattiginoso del frutto esotico hanno un'alta concentrazione di papaina. I frutti maturi hanno una percentuale di papaina molto più bassa rispetto ai frutti acerbi.